最早
琼林诸子，在万历初年便当上
侍郎尚书，甚至登阁拜相，把持万历初年朝政。尽管他们与晋党以及万历皇帝斗争中纷纷下野，然而他们首代弟子已经成长起来，纷纷上位接替，继续把持内阁六部、两京各省……
万历自然不会罢休，他继续斗争，继续把琼林派赶出朝堂，至少赶出北京，眼不见心不烦。据说在东暖阁有
扇屏风，上面密密麻麻写满琼林派成员名单，每当吏部拟任命*员，万历就让人在上面找名字，没有，通过，有，否决。他希望以这种方式，来渐渐完成对琼林派清洗，应该说是个很稳健办法。
然而魔高尺道高丈，万历九年留都大会，琼林派成王门盟主，换言之，全
党！
因为泰州派以市民阶层为基础，自然要对矿监税使展开激烈批判，随着阉祸逐渐升级，批判也逐渐升级，最终必然要付诸行动。事实上，从今年年初起，泰州派上下，就在策划大规模抗税运动。
但在付诸行动之前，他们必须等到琼林派点头。
虽然比起泰州派来，琼林派只能算是王学后辈，然而后生可畏，这个以‘实心学’为内核王学支派，既接地气，又有经世致用、修齐治平高度，经问世便改变王学末流乱象，吸引无数优秀青年加入，并随着其信众成长，举在万历九年留都大会上，被各派公推为王学正宗，开始着手整合各派，统王学。
琼林派能崛起如此迅速，除它高超理论和严密组织之外，还有个不二法门，就藏在其名称中——‘琼林’。
进士登科，赐宴琼林，这在科举取士年代里，对读书人有着无以复加吸引力。
在社团成立之初，沈默等人便认识到文社盛衰，与科场荣辱密切相关，好学之士以文社为学问之地，而驰骛之徒则以文社为功名之门，故而以此为名，来吸引读书人加入。
而在次年抡才大典中，七人全部及第，且全都点中翰林，使‘琼林七子’名号遍及天下，各地学子纷纷登名社录，争入琼林之门。琼林诸子也不遗余力栽培进门弟子，大有把持科场之势。
从嘉靖四十年起，至今八次春闱加两次恩科，共十次大比中，三十名甲进士，琼林派占六成，七百名二甲进士，琼林派占五成，两千五百名三甲进士中，也有三成左右……这还是万历皇帝在八年、十年殿试中，故意排挤琼林派出身进士结果。
对琼林派把持科场，自然有人看不顺眼，些北方和西南士人便公开说：‘孰元孰魁，孰先孰后，琼林已编定无遗人矣。’但无论如何，沈默当初设想借广收门徒，以控制士林、把持科场，最终达到左右政权之目达到。
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